2015年出现由赢转亏后，2016年联华超市依然以亏损收尾。联华超市发布2016年业绩，2016年，公司实现营业额266.66亿元，同比下滑2.0%；净亏损4.50亿元，上年同期亏损4.97亿元，略微收窄。

    联华超市公告称，公司收入下滑主要是由于线下传统零售总额下滑；放缓网点新开速度，梳理网点资源，关闭业绩持续下滑网点；推进商品品类结构调整。同时2016年下半年，网点的改造转型计划逐步实施，转型改造期间网点销售负增长。而亏损有所收窄主要是由于实施线上与线下互动的新兴销售模式及成本下滑等所致。不过，联华超市将大卖场同店销售同比下降2.79%业归因为“主要受线上销售抢占传统零售市场份额的影响”，不过联华超市也表示，将通过调整营业面积，扩大招商面积，降低成本费用，降低库存和人力成本等多种方式实现亏损门店的减亏增盈。

    2016年，联华超市新开门店212家，关闭门店477家，关闭门店中395家为加盟店。其中，大型综合超市业态新开门店1家，关闭门店6家;超级市场业态新开门店120家，新开直营门店10家，新开加盟门店110家，超级市场业务继续保持在上海市场的领先优势;便利业态新开门店91家，其中直营门店35家，加盟门店56家。截止2016年末，公司共拥有门店3618家，较2015年末减少265家，其中：加盟店减少216家，主要由于加盟店遇到与直营店同样的市场问题及本集团严格规范加盟业务。

    另外，联华超市的业绩报告显示，集团同店销售同比下降约为1.23%，其中大型综合超市业态下降2.79%，超级市场业态增长0.61%，便利店业态增长6.31%。虽然便利店业态是唯一正向增长的领域，但也是公司份额最小的领域。2016年，联华超市便利业态实现营业额19.83亿元，占公司营业额约7.4%，同比增长0.7%。而大型综合超市和超级市场业态占公司营业额的比重分别为61.1%和31.2%。

    与2015年相比，联华超市虽然依然亏损，但是销售和盈利同比下滑的速度有所减缓，2015年的营业额约272.23亿元，同比下降约为6.6%；综合收益66.68亿元，同比下降6.5%；经营亏损约1.49亿元，同比由盈转亏，归属于该公司的股东年度亏损约为4.97亿元。

    2015年4月，百联股份发布重组方案称，公司拟将联华超市21.17％的股权以每股3.92港元的价格转让给永辉超市，交易总金额约为7.44亿元。永辉超市成为联华超市第二大股东。2016年12月，联华超市发布公告称，永辉超市与上海易果电子商务有限公司订立股份转让协议，悉数转让永辉超市所持有的本公司股份。今年3月，联华超市董事会相关职位出现一系列变动，张轩松、张经仪等永辉系成员获准辞任，上海易果电子商务有限公司（以下简称“易果”）创始人之一张晔获委任为公司非执行董事、战略委员会成员。